说说我自己的方法：

个人博客一类的小站点，除去reset.css，一般再有一个style.css足已。

网站比较大的话，将基础部分分成：base.css grid.css components.css ie.css等等，components保存所有组件的CSS，命名方式可以参考 BEM ，发布的时候压缩一下。

页面比较多的情况可能要分出header.css footer.css sidebar.css等等，总之这个没有严格的规定，根据业务的不同，选择适合维护和扩展的组织方式。还有就是多看看别人的代码。