你说的分层开发应该是指分布式的。上边答案说的 MVC 框架虽然是分层了，但还是在单机上。

其实 PHP 并不适合做这种分布式的架构，非得要做的话，要处理网络连接，发包解包，进程管理等等，而这些恰恰是 PHP 不擅长的。最近有了 Swoole 这个高性能网络扩展，网络处理做起来应该很容易了。但是进程管理还是个大问题。

通常是选用一些服务开发框架，例如用 Thirft 生成代码，AO，DAO用 C++ 或 Java，接入层用 PHP。