兼容性问题是一个很大的问题，细节很多，要做一个通用的解决方案是比较难的。计算机编程里边有一句话：“任何问题都可以用增加一个层次的方式来解决”，这个问题也是。比如，要考虑UI在各个系统上的接口不一致，可以在Win32，XWindow，OSX等上增加一个兼容层来解决，这个兼容层可以是一个库，现在流行的有QT，wxWidgets等可以解决这个问题。兼容性层的比较极端的例子就是虚拟机，虚拟机就屏蔽了绝大部分的OS的差异。
在windows上开发，考虑32和64位间的问题，微软提供了一个编译选项/Wp64，编译的时候监测检测64位可移植性问题